空氣微生物采樣器按采樣原理不同大致可分為：過濾式、撞擊式、離心式和液體沖擊式采樣器。都必須吸引空氣進入采樣器，才能收集空氣微生物。
空氣微生物采樣器對微生物的分析方法有兩大類：
培養方法是將采集到的活的空氣微生物，在半固態的營養培養基上經過培養繁殖生成菌落，用目視鑒別和計數，其結果用菌落數表示。用培養方法分析樣品，必須根據采樣目的和空氣環境類型，選擇適當的采樣時間，使每一個樣品都收集到足夠的帶菌粒子是非常重要的，以保證采樣結果在統計學上具有顯著性和代表性。因為塑料培養皿上的靜電電荷的吸附作用，在撞擊式采樣器中，使用塑料培養皿會引起收集效率降低20％，所以一般應選用標準玻璃培養皿。
非培養直接計數方法 非培養直接計數方法是在采樣后的樣品不經過培養就可進行微生物鑒別和計數的方法，不要求微生物能否培養，所有的微生物粒子，包括死的或活的，凡是使人致病的全部微生物粒子都應當計數。因此，直接計數方法測出來的微生物數量往往比培養方法的高得多。
空氣微生物采樣器采樣具體步驟：
安裝與消毒 將選擇好的濾膜安裝在采樣夾里，并認真檢查安裝是否合乎要求，然 后用紫外線(UV)將濾膜和采樣夾進行消毒。
進行采樣 過濾式空氣采樣器的空氣采樣流量準確程度直接影響采樣結果，在采樣 前應用皂膜流量計校準采樣泵的流量。將采樣夾用真空管與便攜式恒流采樣泵連接，啟動采 樣泵進行采樣。
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